早在春秋战国时期，匈奴、东胡、林胡、楼烦等族活跃在北方的草原上，西乌珠穆沁旗在这一时期是东胡族活动的地方。                        

西汉初年，东胡分裂为乌桓、鲜卑。两汉时期，这两族与匈奴都游牧过这里的草原。首先是兴起的是匈奴族，这个强悍的民族创建了中国历史上第一个游牧民族的统一政权，并与秦汉进行了长达300多年战争，在历史上留下了自己浓重的一笔。1986年，在西乌旗吉林郭勒苏木境内，发现了长约1000米，高约1米的城墙，城墙内有三间房屋大小的方形小土堆，经考证认定为东汉时匈奴人所建，现已被定为盟级文物保护单位。

在中原战乱纷争的三国时期，这里远离战火与硝烟，从大鲜卑山（今呼伦贝尔市鄂伦春自治旗西北的大兴安岭一带）向西南迁徙的拓跋鲜卑来到了这里。或许正是这片殷实的土地给了他们南进中原，与东晋隔河对峙的坚实基础。随着鲜卑的离开，北魏时，这里又迎来了契丹族，这个民族曾经叱咤北方草原，与宋朝拥兵对峙，建立了辽朝。

隋唐时，这一地区归东突厥库莫奚部，隶属于突厥单于都护府。元朝建立后，这里又属岭北行省和宁路济南王部管辖。明朝初年，北元政权摇摇欲坠，随后兴起的蒙古族鞑靼部与奴儿干相争此地。到了明英宗年间，达延汗巴图孟克统一漠北蒙古各部后，设置察哈尔万户管辖锡林郭勒盟地区，万户之下又设立8个鄂托克，浩齐特鄂托克与乌珠穆沁鄂托克共同管辖今天的西乌旗全境。那么，为什么这一时期会出现乌珠穆沁鄂托克呢？这是由于明朝中期，元太祖成吉思汗十六世孙图鲁博罗特，由杭爱山徒牧翰海南。图鲁博罗特的儿子博第阿剌克"子承父业"继续在这里游牧，而博第阿剌克的第三子翁衮都剌尔号所管辖的部落被称为乌珠穆沁，因此根据各首领管辖的部落名称设立了相应的鄂托克。清崇德二年（公元1637年），翁衮都剌尔号的幼子，也就是博第阿剌克的孙子，多尔吉率乌珠穆沁部归附清朝。根据在内蒙古地区实行的盟旗制度，清政府设立了乌珠穆沁左、右翼两旗。右旗建于清崇德六年（1641年），多尔吉为乌珠穆沁右翼旗扎萨克和硕车臣亲王，职位世袭，俗称西乌珠穆沁旗。从此，乌珠穆沁之名成为旗名，而人们通常所称的"乌珠穆沁"一般是指东、西乌珠穆沁两旗。

 "乌珠穆沁"，原为外蒙古阿尔泰山脉葡萄山一带的游牧部落名称。起先，"乌珠穆沁"人生活在一个叫乌珠穆山的地方，山上长满葡萄。"乌珠穆"蒙语意为葡萄，"沁"蒙语意为……的人，因此"乌珠穆沁"就是蒙语葡萄山的人。直到今天，在乌珠穆沁仍流传着这样一个传说：我们是来自"乌珠穆沁查干乌拉"、"嘎拉巴尚哈戈壁"的"马镫叮当响，羊儿咩咩叫"的地方。然而，让人迷惑不解的是，既然是从盛产葡萄的地方迁徙而来，为什么又选择这里作为落脚点？或许是这里丰美的水草深深地吸引了他们！

1947年5月1日，内蒙古自治区成立。1956年，行政区划重新划分，设东乌珠穆沁旗、西乌珠穆沁旗两旗。1966年，西乌旗旗政府驻地王盖庙改称巴彦乌拉镇，这一名称一直沿用至今。"巴彦乌拉"是蒙古语，意为富饶的山。今天的巴彦乌拉镇，正像它的名字那样欣欣向荣，生机勃发。